本书（六册一、○一四面六○八、四○○字）不分卷，据赵尔巽、柯劭忞等撰修「清史稿」关内本选辑。原书依史例分本纪、志、表及列传四门，凡五百三十六卷。本书就中选集关系明郑与台湾之史料，仍依纪、志、表、传列目：「本纪」分世祖、圣祖、世宗、高宗、仁宗、宣宗、文宗、穆宗、德宗九纪（原太祖、太宗及宣统三纪均无所取），上自顺治元年清兵入关，下讫光绪二十一年台湾沦日；凡与南明以降至于郑氏三世以及台湾在清代之始末所有资料，均予选取。「志」取「地理志」之「台湾」一节外，余如「食货志」之户口、田制、盐法、矿金、征榷、「兵志」之绿营、水师、海防、「交通志」之电报、「邦交志」之英吉利、法兰西、美利坚、德意志、日本、和兰（荷兰）及日斯巴尼亚（西班牙），均撷其与台湾有关之记载。「表」仅由「诸臣封爵世表」及「疆臣年表」选编二表：「诸臣封爵世表」，取清初至末叶涉及明郑与台湾史事之人物，依等分列；「疆臣年表」，选统辖闽台之总督与巡抚两职合辑。「列传」所取，在台湾入清以前，凡涉及明郑史事之人物均在采选之列；